Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms