Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms