Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms