Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIX1LQ8IVB5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms