Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAPLN4Q86UW8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAPLN4Q86UW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms