Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMS1Q86UR5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms