Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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