Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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