Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms