Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms