Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms