Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms