Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP12Q6UXS9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms