Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSTM1Q6UX27 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms