Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms