Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM4Q6P4Q7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNNM4Q6P4Q7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms