Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JMJD6Q6NYC1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JMJD6Q6NYC1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms