Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KANK3Q6NY19 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms