Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD4Q5VX71 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms