Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms