Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms