Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms