Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms