Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN3Q4LDR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN3Q4LDR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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