Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms