Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP28Q4G0W2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms