Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms