Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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