Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR2Q16832 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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