Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F4Q16254 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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