Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETFDHQ16134 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms