Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6AP1Q15904 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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