Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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