Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CDSNQ15517 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CDSNQ15517 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CDSNQ15517 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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