Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERC3Q15034 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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