Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A1Q14973 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms