Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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