Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBFBQ13951 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms