Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGA9Q13797 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ITGA9Q13797 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ITGA9Q13797 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ITGA9Q13797 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ITGA9Q13797 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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ITGA9Q13797 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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