Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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SHROOM2Q13796 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
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