Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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