Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF5Q13568 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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