Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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