Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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IFT88Q13099 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
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IFT88Q13099 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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IFT88Q13099 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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