Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GPS1Q13098 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPS1Q13098 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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