Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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