Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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