Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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