Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC10A2Q12908 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC10A2Q12908 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms