Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNH2Q12809 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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KCNH2Q12809 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNH2Q12809 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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